¡Ajá! Muchos pensábais que estaba acabado, pero no va a pasar un año sin que publique nada por aquí. 😉
Os presento un comando que sirve para contar cuántas veces se repite una cadena de caracteres en un fichero.
$ fgrep -o ">" file.fas | wc -l
Este ejemplo sirve para contar el número de secuencias de un fichero FASTA. fgrep imprime la cadena cada vez que la encuentra en el fichero y wc cuentra el número de veces que lo repite.
Hasta la próxima.
Un Bioinformatiquillo 
Hola, muy bueno tu blog.
No hace lo mismo?
grep -c ‘>’ file.fas
Como pueda cantar la cantidad de cada aminoacidos en una secuencia de proteinas