7 comentarios el “Repositorios Bio-Linux para Ubuntu

  1. Pingback: [Bioinformática] Ejecutar BLAST de manera local con base de datos propia « Un Bioinformatiquillo

    • Sí. Tengo los repositorios funcionando en una Debian 6.0.2 y van bien. Alguna vez me ha dado algún problema al actualizar los repositorios que he solucionado comentando la línea y volviendo a actualizarlos.

      Saludos.

  2. OKas, muchisimas gracias por responder n.n, soy nuevo en esto de gnu-linux y la Bioinformatica, muy bonito tu blog, sigue adelante y exitos en tus labores =)

    Saludos desde el pulgarcito de America ^^

  3. Hola, muy interesante tu blog!

    Una cosilla sobre el tema, estos repositorios sólo van en la 10.04, no? Yo los utilizo sobre todo para el Staden, que compilarlo es un rollo (necesita tropecientas librerías de desarrollo que en ubuntu encima tienen nombres diferentes..) total, que si actualizas a la 10.10 en adelante los repositorios se fastidian y te quedas sin actualizaciones del software de bio-linux, aunque los programas que se instalaron por lo menos siguen funcionando.

    Sabes si para la 12.04 los de biolinux van a sacar nuevos repos? O si hay alguna solución a lo de “sudo aptitude dist-upgrade” y que tengas actualizaciones de software de estos útiles repositorios ?

    Un saludo.
    F.

    • Hola Fertxu.

      Esto dice en la web de Bio-Linux:

      Bio-Linux packages can be installed on 64 bit Ubuntu, Debian or Debian variants. The majority of Bio-Linux 6 bioinformatics software is installed from a centralised repository located on the NEBC server. Legacy packages are available for 32 bit systems, but these are not being maintained as of June 4, 2010.

      Según lo cual, para 32 bits el respositorio no se está actualizando, solo para 64.

      Yo aún uso Ubuntu 10.04 32b y Debian Lenny 64b en las que no tengo problema alguno.

      Saludos.

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